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湖南大學等開發流感病毒預測預警平臺

2月12日,湖南大學聯合蘇州系統醫學研究所、中國國家流感中心和中山大學等單位,成功開發基于分子標記物的流感病毒表型預測平臺FluPhenotype,并在國際生物信息學專業權威期刊《Bioinformatics》發表題為“FluPhenotype-a one-stop platform for early warnings of the influenza A virus"的文章進行相關介紹。該文章的第一作者為湖南大學生物學院碩士研究生盧聰毓和博士研究生蔡澤娜,通訊作者為湖南大學生物學院副教授彭友松與蘇州系統醫學研究所蔣太交教授。

論文首頁

研究人員通過整合流感病毒核苷酸和氨基酸水平的分子標記物,以及基于分子標記物的抗原和宿主等預測模型,開發了快速預測流感病毒的抗原、宿主、致病性、耐藥性等多個表型的預測平臺FluPhenotype。(網址:http://www.computationalbiology.cn:18888/IVEW)

平臺FluPhenotype

FluPhenotype平臺的輸入為流感病毒的基因組或者蛋白序列,將自動從基因組或者蛋白序列中抽提分子標記物和序列特征進行病毒表型的預測,輸出對于流感病毒的抗原特征、潛在感染宿主、對于哺乳動物的致病性以及對于抗流感病毒藥物的耐藥性等四個方面的表型,為綜合評估該病毒發生和播散的風險提供科學依據,有助于新發突發流感病毒的預測預警。

論文鏈接:

https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btaa083/5734644?guestAccessKey=21482286-0b4f-4c8c-9727-9bf1a19ef4b4

來源:宣傳部 生物學院

記者:蔣鼎邦

責任編輯:蔣鼎邦